記者從中國科學院大連化學物理研究所獲悉，該所研究員樸海龍團隊利用生物信息學和機器學習方法，基于代謝物—蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡和癌癥多組學數(shù)據(jù)，定義了代謝方面具有顯著差異性的肝癌亞型，并揭示出不同肝癌亞型在預后、免疫、腫瘤微環(huán)境、甲基化調(diào)控等方面的生物學特征，為肝癌精準醫(yī)療提供了重要線索。相關研究成果近日是發(fā)表在《先進科學》上。

癌細胞的獨特標志是通過調(diào)節(jié)能量及營養(yǎng)物質(zhì)代謝，代謝重編程能夠促進細胞快速生長和增殖。其作用不僅體現(xiàn)在代謝通路的變化，還可以通過復雜的代謝物—蛋白質(zhì)相互作用傳播到其他細胞或組織的生物學過程中。該研究中，基于代謝物—蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡和肝癌多組學數(shù)據(jù)，研究團隊綜合利用復雜網(wǎng)絡和機器學習分析方法，識別了兩種在疾病預后具有顯著差異性的肝癌亞型。

研究發(fā)現(xiàn)，在代謝方面，預后較差的肝癌亞型主要與代謝環(huán)境缺氧、代謝酶的高度甲基化、眾多代謝通路的下調(diào)及多種脂肪酸的累積密切相關。同時，眾多與機體免疫相關的通路在預后較差的亞型中呈現(xiàn)顯著上調(diào)的趨勢。通過觀察分析代謝物—蛋白質(zhì)的相互作用，團隊預測，不飽和脂肪酸與多個免疫調(diào)控蛋白存在潛在影響，不飽和脂肪酸的累積可能是免疫通路上調(diào)的原因之一。這些肝癌亞型及其生物學特征在多組獨立的肝癌隊列上得到驗證。

此外，研究人員利用肝癌細胞系，通過轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學實驗也驗證了該研究中的計算分析結(jié)果。(記者 郝曉明)