全球視點!我科研人員發(fā)現(xiàn)接近完整的白菜基因組
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原標題:我科研人員發(fā)現(xiàn)接近完整的白菜基因組
工人日報-中工網(wǎng)記者 黃哲雯 通訊員 陳旭
記者從中國農(nóng)科院獲悉 ,近日,該院的蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組,揭示白菜著絲粒的快速進化特征。相關研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(Plant Biotechnology Journal)》上。
白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口,其10條染色體的著絲粒結構組裝均不完整。
據(jù)介紹,該團隊利用三代測序技術,獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個缺口;該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。
研究還發(fā)現(xiàn),著絲粒區(qū)域長末端重復序列的平均插入時間為14萬年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進化。
該研究得到國家重點研發(fā)計劃、中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程項目等項目的支持。
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